Um fator, cada vez mais bem documentado, é a interferência do anticorpo materno— adquirido no útero através da placenta — que pode reduzir a disponibilidade do antígeno, reduzir a replicação viral (no caso de vacinas virais vivas, como a do sarampo ) ou talvez regular as respostas das células B. No entanto, também há evidências de que há um aumento fisiológico dependente da idade nas respostas de anticorpos na infância . Além disso, os nichos da medula óssea para dar suporte às células B são limitados na infância, o que pode explicar as respostas imunes de vida muito curta documentadas no primeiro ano de vida. Por exemplo, após a imunização com 2 doses da vacina meningocócica capsular do grupo C na infância, apenas 41% dos bebês ainda apresentavam níveis protetores de anticorpos no momento da dose de reforço, administrada 7 meses depois .
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No caso de antígenos independentes de células T — em outras palavras, polissacarídeos simples de Hib, bactérias causadoras de febre tifoide, meningococos e pneumococos — dados em animais indicam que as respostas de anticorpos dependem do desenvolvimento da zona marginal do baço, que é necessária para a maturação das células B da zona marginal, e isso não ocorre até cerca de 18 meses de idade em bebês humanos . Essas vacinas de polissacarídeos simples não induzem células B de memória (Fig. 6 ) e, mesmo em adultos, fornecem proteção por apenas 2 a 3 anos, com proteção resultante de anticorpos produzidos por células plasmáticas derivadas de células B da zona marginal . No entanto, a conversão de vacinas polissacarídicas simples em vacinas conjugadas de proteína-polissacarídeo dependentes de células T, que são imunogênicas a partir dos 2 meses de idade e induzem memória imunológica, transformou a prevenção de doenças causadas por bactérias encapsuladas (pneumococos, Hib e meningococos) nas últimas três décadas. Esses são os patógenos bacterianos invasivos mais importantes da infância, causando a maioria dos casos de meningite e pneumonia bacteriana na infância, e o desenvolvimento da tecnologia de vacinas conjugadas na década de 1980 transformou a saúde infantil global .